學院設有辦公室、教務處、后勤處、保衛處、學生處、團委、少年社會工作站、黨群辦、計財處、招生就業辦、培訓中心、學籍科等完善的管理機構。奉行專家治校，民主管理的教育管理原則。有一支業務技能精、管理水平高、創新能力強的高素質、職業化管理班子。
        文山州衛生學校是文山州的一所公辦全日制醫藥衛生類中等職業學校,屬國家級重點中等職業學校和省級文明學校、綠色學校，并被州委、州政府列為職業教育改革試點學校。
        凡符合報考普通中等專業學校招生條件，立志從事醫療衛生工作的應、往屆初中畢業生均可報讀，學校按相關政策擇優錄取。凡錄取就讀同學,均可享受國家對中職教育的助學政策。在校期間可通過參加昆明醫科大自學考試、云南開放大學“中高銜接”學習或第三年參加成人高考就讀高一級學院的成人教育獲得專科學歷。
學校創建于1958年，歷經5次搬遷，于2012年11月28日率先整體遷入職教園區內辦學。現占地面積360畝，并有60畝的附屬醫院預留用地，現已建成的一期校舍建筑面積4.7萬平方米，其中實訓中心數碼顯微實驗室、婦產科、兒科、生理機能實驗室、護理實驗室、生命科學館達到省內同級學校先進水平，現正在籌備建設具有“中國中藥生物谷”特色的中醫實訓基地。
        學校于2012年11月28日搬遷到州職教園區辦學。占地面積420余畝，建筑面積4.7萬㎡。現有教職工191人，其中專任教師163人，高級教師55人，“雙師型”教師55人，研究生學歷17人，云南省“云嶺名師”1人、“省級學科帶頭人”2人、“州級學科帶頭人”4人。實訓設備中的數碼顯微實驗室、婦產科、兒科、生理機能實驗室、護理實驗室、生命科學館達到省內同級學校先進水平。學校全日制在校學生4884人，與高校合辦成人教育學生3189人，是文山州中職學校中辦學規模最大的學校。學校設有普通中專、職業培訓、成人教育三個招生類別。學校全日制中專開設護理、醫學檢驗技術、醫學影像技術、農村醫學、助產、藥劑、中醫等7個專業。專科層面，與紅河衛生職業學院、大理學院聯合開辦五年制專科護理。